L'île de Wa no kuni fait en fait partie d'une plus grande formation géologique ressemblant à une montagne ou à un volcan. Son centre, où Wa est situé, et ses bords sont en fait très élevés par rapport à l'espace intermédiaire, qui descend près du niveau de la mer et est rempli d'eau douce. Cette composition en forme de bol conduit à un écoulement d'eau unique où l'eau douce s'écoule dans l’océan du Nouveau Monde sous formes de cascades et, aux sommets de celles-ci, on trouve des courants qui se heurtent et conduisent à la formation de tourbillons. L'eau de mer est également connue pour s'écouler d'une manière ou d'une autre à l'intérieur des terres. Dans la mer entourant Wa, on trouve des colonnes de roches qui sortent des flots et sur lesquels poussent quelques arbres.

L’océan entourant Wa no kuni est toujours secoués d’un temps orageux, avec des vents forts et inhabituels qui font que les nuages et les vagues de l'océan prennent des formes de tourbillons. Le pays de Wa n'a que deux méthodes connues d'entrée par l'océan. Le plus difficile consiste à attacher des navires aux koi géants qui grimpent régulièrement les cascades environnantes depuis la mer, permettant aux poissons de les tirer. L'autre méthode consiste à entrer dans un tunnel caché situé derrière l'une des chutes d'eau, qui mène au port de Mogura, où les personnes et les marchandises peuvent être transportées à l'intérieur des terres par une nacelle faisant office d’ascenseur pour monter jusqu’à Wa. Cette dernière méthode, cependant, est limitée à ceux qui reçoivent l’autorisation des dirigeants du pays.

Wa no kuni comporte une rivière qui divise la terre en six zones appelées régions chacune gouvernés par un daimyo. Ces six régions sont Kuri au sud, Kibi à l’ouest, Udon au sud-est, Hakumai au nord-est, Ringo au nord-ouest et la Capitale des Fleur au centre qui est également la capitale du pays qui est érigé aux pieds du Mont Fuji. Chacune d’entre elle dispose de son propre climat : Ringo est par exemple une région hivernale. À l’est du pays sort des flots l’île d’Onigashima qui a la forme d’un crâne d’Oni géant qui est rattaché au pays sans en être une région. Outre le Port de Mogura reliant le pays au niveau de la mer, Wa no kuni dispose de cinq ports, une part région en dehors de la capitale : le port d’Itachi à Kuri, le port de Neko à Kibi, le port de Tokage à Udon, le port d’Habu à Hakumai et le port de Kaeru à Ringo. De par sa position surélevée par rapport à l’océan du Nouveau Monde, les terres de Wa sont protégées des tempêtes dévastatrices arpentant l’océan déchaîné entourant l’île.

La faune et la flore de l’île est riche et dense. Les animaux terrestres comprennent des créatures géantes utilisées pour l'équitation, comme un babouin brandissant un katana, un komainu, un lézard bipède et une créature hybride de type crocodile-requin appelée Wanizame. Des animaux plus petits et de taille régulière peuvent également être trouvés à Wa comme les tigres, les sangliers, les cerfs, les chiens viverrins, les carpes ect.

Redouté pour disposer d'une puissance militaire importante à l'image de sa rivale qu'est Kingadomu, on dit que ce lieu a toujours été en guerre et isolé sur lui même. L'île a prouvé au fil des siècles êtres imprenable pour le Gouvernement Mondial et même les Yonkous en raison de la difficulté d'atteindre le pays ainsi que les forces armées sur place connus comme redoutables. Depuis des dizaines de générations, les habitants de ce pays s'entre-déchirent dans des guerres de clan entre daimyo pour devenir shogun de Wa, ce  qui amena presque à l'extinction de la population et des valeurs locales. Ce n'est qu'il y a un peu plus d'une quarantaine ou cinquantaine d'années, lorsque Kouji Taka est devenu Yonkou et a pris ces lieux sous sa tutelle que la guerre s'est définitivement apaisée et a fini par mourir tandis que les clans des deux derniers daimyo prétendant au post de shogun décidèrent de s'unir sous la bannière de cet homme. Depuis, chaque nouvelle génération jure fidélité au père et au fils qui ont établi leur principale base ici. Le père de Kouji Taka, celui qui a commencé à développer le Yoso Kanri, fut shogun avant son fils, mais ne parvint pas à stopper la querelle des deux daimyos voulant obtenir sa place. L'arrivée de Kouj au pouvoir a également permit de sortir progressivement Wa de son isolationnisme.

Outre cet état des choses, un autre élément est à noter : le temple au centre de la forêt a été le lieu de nombreuses épreuves, et aujourd'hui encore il renferme le célèbre sabre Masamune. On dit que cette arme de légende a appartenu au premier samouraï. Certains pensent que son esprit habiterait encore le temple et attendrait l'arrivée d'un prodige pour lui céder la lame. Pour le représenter, trois samouraïs sont choisis tous les vingt ans pour faire passer les épreuves aux personnes qui tenteraient d'obtenir ce bien. Jusqu'alors, il est dit que seul Eko aurait réussi cet exploit. Sa sagesse l'a cependant poussé à remettre le katana en ces lieux : il s'agit d'un trésor pour l'île, et c'est le garant d'une certaine unité en ces lieux.

Le port d'Itachi a aussi une histoire. D'abord divisé entre deux parties, on peut encore y trouver des tranchées, héritages d'une guerre de longue haleine entre les deux camps qui s'affrontaient pour la position de shogun. Il y a dix ans, Eko a symboliquement fait construire une statue à l'effigie de deux hommes en son centre : ainsi on peut observer dos contre dos, l'arme à la main, les visages des deux plus grands guerriers des deux clans, bien qu'ils n'aient pas vécu à la même époque, symbolisant cette union sacrée.

L'île est de taille continentale.

La plupart du temps, il s'agit du shogun Eko Taka et de ses lieutenants. En son absence, les deux descendants des clans d'autrefois, le daimyo Miyaki Kitsune d'Hakumai et le daimyo Arhid Kuma de Udon (Lvl 45 et 44) sont les garants de la sécurité de l'île. Ils ont sous leurs ordres des samouraïs d'élite (Level 30 à 35, 40 pour les meilleurs ne faisant pas parti de l'équipage d'Eko) ainsi que les membres de l'équipage d'Eko qui sont de passage ici. Les daimyos des autres régions sont Yokono Wazuri à Ringo (lvl 36), Hiroshi Okada à Kibi (lvl 35) et Suidon Kyaketsu à Kuri (lvl 40).

Cette île est la capitale de l'Empire d'Eko Taka.